近期，華為與昌平實驗室、北京大學生物醫(yī)學前沿創(chuàng)新中心（BIOPIC）和化學與分子工程學院、深圳灣實驗室高毅勤教授課題組及鵬城實驗室陳杰團隊基于全場景AI框架昇思MindSpore開發(fā)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測模型，在全球持續(xù)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測競賽CAMEO（Continous Automated Model EvaluatiOn）獲得全球第一的好成績。這顯示出昇騰AI基礎軟硬件平臺在 AI+科學計算 領域的強大能力。
4月21日最新月榜競賽結(jié)果
超越業(yè)界標桿，連續(xù)三周保持全球第一排名
蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測是人工智能走進生命科學的關鍵成果之一，對生物學研究意義重大。2020年12月，《科學》雜志評選了該年度十個重大科學突破，蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測的人工智能AlphaFold就是其中非常重要的一項，因此AlphaFold成為生物研究領域的標桿成果，更是一塊重要里程碑。
昇思MindSpore蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測模型研發(fā)進展
2021年11月，華為昇思MindSpore團隊與昌平實驗室、北京大學生物醫(yī)學前沿創(chuàng)新中心（BIOPIC）和化學與分子工程學院、深圳灣實驗室高毅勤教授課題組聯(lián)合推出基于AlphaFold2算法的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測推理工具，并在2022年2月實現(xiàn)訓練的全流程打通，效率同比提升2-3倍。
采用昇騰AI基礎軟硬件平臺后，在混合精度下，單步迭代時間由20秒縮短到12秒，性能提升超過60%。依托昇思MindSpore內(nèi)存復用能力，訓練序列長度由384提升至512。
在訓練精度接近AlphaFold2的基礎上，昇思MindSpore在算法、規(guī)模和軟硬件支持等方向上持續(xù)改進，本次發(fā)布的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測模型成績持續(xù)刷新業(yè)界記錄、拿下CAMEO競賽第一，是昇思MindSpore在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測領域的又一里程碑，在填補國產(chǎn)人工智能基礎軟硬件在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測領域成績空白的同時，更加證明了其價值與優(yōu)越性。
由瑞士生物信息研究所和巴塞爾大學聯(lián)合舉辦的 CAMEO（Continous Automated Model EvaluatiOn）——全球持續(xù)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測競賽，被認為是蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測領域最重要的比賽之一。CAMEO 競賽的規(guī)則是，每位參賽者需每周對 20 個由世界范圍內(nèi)的結(jié)構(gòu)生物學家最新破解出的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)進行預測，其分數(shù)和名次每周都會進行在線更新。
該競賽吸引了眾多世界范圍內(nèi)生物計算領域的前沿模型“選手”基于昇思MindSpore AI框架訓練的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測模型，一經(jīng)亮相，便領跑全球。在最近的三周CAMEO競賽中持續(xù)排名第一，意味著昇騰AI基礎軟硬件平臺在AI for Science領域的強大能力。
未來，針對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測問題，昇思MindSpore將攜手學術科研界更多合作伙伴，在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測領域共同探索、持續(xù)突破，助力國內(nèi)相關基礎研究，尤其是生命各分支學科的進步，推動創(chuàng)新制藥行業(yè)的發(fā)展。
